一次性PCR擴增可以設置一系列不同的退火溫度條件（通常12種溫度梯度）的稱之為梯度PCR儀。因為被擴增的不同的DNApian段其適合的退火溫度不同，通過設置一系列的梯度退火溫度進行擴增，從而一次性PCR擴增就可以篩選出表達量高的適合退火溫度進行有效的擴增。主要用于研究未知DNA退火溫度的擴增，這樣既節約時間，也節約經費。在不設置梯度的情況下亦可當做普通的PCR用。

正真的梯度，是每一排管都有的加熱控溫探頭，2009年為止只有美國ABI公司可以做到。其他的都是從兩頭的熱傳遞來設計控溫。

梯度pcr儀就是可以允許用戶在退火步驟時選擇同時進行不同的退火溫度以篩選佳退火溫度。以wealtec的SEDI G為例，96孔控溫模塊按照8x12排布，解鏈步驟設置完后，設置退火步驟時，可以選擇“梯度步驟”，此時程序會允許你設置梯度溫控范圍，讓12個縱列孔位在此步驟時以不同溫度運行。

注意事項：
a、儀器后面有通風口，為保持通風口的通暢，后兩端必須離開墻壁 10－15cm，不要在儀器的周圍堆放雜物。
b、本儀器可在 5℃－40℃的環境下使用，適環境溫度為 15℃－30℃，嚴禁在低于 5℃的環境下開機。環境濕度范圍為 20－80％。
c、建議PCR反應結束后，取出樣品，不要過夜4℃保存樣品。

注：PCR儀適用于分子生物學、醫學、食品工業、司法科學、生物技術、環境科學、微生物學、臨床診斷、流行病學、遺傳學、基因芯片、基因檢測、基因克隆、基因表達等領域以聚合酶鏈式反應（Picymerase Chain Reaction , PCR）為特征的、以檢測DNA/RNA為目的的各種病原體檢測及基因分析。欲知多梯度PCR儀知識請訪問萊普特科學儀器（http://m.xuanwu-technology.cn/com_leopardchina/