凝膠成像基本由CCD相機、鏡頭、暗室和分析軟件組成，不過其功能不僅僅限于對瓊脂糖凝膠進行成像，現在的成像儀趨向于多功能化，在Western Blot方面，高性能的化學發光成像系統能與膠片媲美。還適用于蛋白膠、核酸、多肽、氨基酸、多聚氨基酸、印跡膜和菌落平板等應用。那么，該如何合理選擇凝膠成像系統呢？選擇凝膠成像系統的時候須注意哪些問題呢？
一、TOCAN凝膠成像，如需直接切膠，先按系統中間的觀察窗，打開裝有進口防紫外玻璃的觀察窗口，然后打開左右兩側專為割膠所設計的小門，即可進行切膠操作。
二、三個重要的可調參數分別是焦距，聚焦和光圈。其中焦距調節清晰度，聚焦調節圖像大小，光圈調節明暗。一般先把光圈調節到適宜的亮度后，再調節聚焦將圖像放到大，后調解焦距，在圖像較大的情況下焦距比較容易調節到清晰狀態，然后再把圖像縮放在適宜大小后成像即可。
三、CCD的主要技術參數有CCD尺寸，有效像素，信噪比，采集位數等。其中CCD尺寸與信噪比都是影響成像的關鍵因素，尺寸越大能接受的信號就越多。而熱噪音越低，信噪比就越高，成像質量也就越好。采集位數指色彩灰度的表達范圍。
四、分辨率與像素值的關系。一般來講像素越多，成像也就越清晰細膩，當然這其中還要受許多因素限制。但是高像素也不一定是好的CCD，其原因就是像素大小(PixelSize)，也是很重要的因素，相同數目的像素，排列越密集，像素之間就越容易出現電流干擾，容易出現"噪點"等干擾成像質量的現象出現。由于制造工藝的限制，增加尺寸，成本將會以幾何級數提高。
五、動態范圍決定著你能否同時在一張膠上同時看到強的信號和弱的信號，而且他們之間能保持比較好的定量關系。一般動態范圍采用數量級來表示，這個數越大，表明動態范圍越寬。灰階表示一種表征光亮度的方法，12bit表示從暗到亮等分為212=4096個級別，16bit即分為216個級別，可見bit值越高能分出的細微差別越大。
六、軟件功能，關注的幾個特點：
1、軟件的基本功能：可對不同樣品，如條帶，斑點，細菌克隆，芯片，細胞或者活體動物等，進行定性、定量分析，加批注，輸出圖像等操作。
2、圖像采集方式：對于化學發光或多色熒光產品，軟件應具備電影模式，可以進行圖像多禎累計功能來增強線性動態范圍和數據準確度。
3、曝光方式：應采用單一曝光、多重曝光，累計曝光，延時(定時)曝光多種模式可選。
4、記憶功能：軟件能記憶并自動調用成像數據，這樣你不用每次設置就能獲得重復性好的結果。
5、軟件應配備兩套以上，使用單機版，多用戶版或網絡版，用戶可彼此操作，互不干擾，互不混淆。
6、操作簡便，軟件應具備操作輔助工具，使軟件操作簡單易用。采用三步式泳道及條帶分析，可以快速計算蛋白質和核酸的分子量及含量。
7、數據庫功能也是必不可少的，這樣可以檢索、分類或比較所有生成的圖像。可利用不同的顯示算法程序圖像化顯示條帶差異。
七、制冷CCD適用的情況。對CCD噪音的降低要求很高，應選用高分辨率數字冷卻CCD相機結合高通透鏡頭系統，使其能夠捕獲到信號其微弱的熒光及化學發光樣品圖像，并且能夠大程度的降低噪音，減少背景，提供出色的圖像清晰度。另外可選激發光源及多位濾鏡輪擴大了熒光/化學發光成像的應用范圍。
八、信噪比和暗電流與CCD有的關系。通常情況下，通過降低CCD的溫度來大限度的減少暗電流對成像的影響。CCD產生的暗電流隨著溫度下降而減少，但是在-23℃下曲線開始趨于平緩，由此可以看出溫度并非需要無休止的降低的。所以在選擇冷CCD時，溫度在-25℃(溫度，非室溫以下)下一般就可以達到您的要求了。
九、像素越高不是成像清晰，產品就越好。
十、CCD和CMOS在制造上的主要區別是CCD是集成在半導體單晶材料上，而CMOS是集成在被稱做金屬氧化物的半導體材料上。CCD與CMOS孰優孰劣不能一概而論，但一般而言，普及型的數碼相機中使用CCD芯片的成像質量要好一些。
十一、CCD的量子效率也稱像素靈敏度，指在一定的曝光量下,像素勢阱中所積累的電荷數與入射到像素表面上的光子數之比。不同結構的CCD其量子效率差異很大。值得注意的是CCD的量子效率與入射光的波長有關。動態范圍的值越高CCD性能越好。
十二、自動變焦鏡頭無需手動調節，可操作性強，同時也減少了EB潛在的污染機會。再者使得將CCD內置成為了可能，從而達到防灰防塵防震的目的，好地保護了核心部件延長產品的使用壽命。
十三、紫外對人體，特別是眼睛有一定傷害，TOCAN凝膠成像系統具備紫外防護設施，在紫外燈開啟的狀態下，如不慎打開暗箱，紫外燈會自動熄滅防止對人體的傷害。